El hombre lobo 03x06: Decididos a encontrar respuestas y tras el hallazgo de Marcos, él y sus amigos deciden bajar de nuevo a los pasadizos. Mientras tanto, Jacinta trata de que Elsa le haga a María una oferta de trabajo, algo que ayudará a que la dejen salir. Para convencerla le cuenta su gran secreto: Iván es el hijo biológico de María. Elsa no ve con muy buen ojos este hecho hasta que Jacinta le cuenta los verdaderos motivos por los que María se escapó del centro: le cuenta que vino en busca de su hijo, al que tuvo cuando era una adolescente y que su novio vendió a su queridísimo Noiret. Es entonces cuando Elsa se replantea si la contrata o no, pero antes prefiere hablar con Iván. Iván, que conoce el peligro que correría María si vuelve, ya que su padre la podría matar, le dice a Elsa que no quiere que vuelva, pero ella no cree esa parte de Iván y decide citar al mismísimo Noiret. En su despacho, la pareja mantiene una nueva discusión en la cual, una vez más, la mujer sale victoriosa.
Fermín ha conseguido que un psiquiatra de su confianza y ajeno al hospital examine a María. El problema es que lo sucedido en el Internado en el último año es difícil de explicar para cualquiera y todo lo que dice la limpiadora suena bastante incoherente. A pesar de eso, el psiquiátrica consigue que la mujer le revela un dato de gran importancia: No quiere volver al internado ya que está segura de que un hombre la quiere matar.
Por otro lado, el director se quiere adelantar a los pasos de María, ya que les puede delatar con los métodos que utiliza, por eso hace creer a María que el otro psicólogo es el que ha mandado su abogada, pero todo era finalmente un montaje para sacar información a María sobre lo que le va a decir al autentico psicólogo, el que manda su abogada. De esta forma le da tiempo a desmontar los aparatos de electroshock que esta utilizando con María para borrarle la memoria. Fermín, que ve las verdaderas intenciones que tiene el doctor, le hace un regalo a María, pero ese regalo es algo mas que un simple colgante, ya que en su interior se esconde una cámara con la que Fermín ve lo que está haciendo el doctor con María desde El Internado. Esta, es la prueba que Fermín necesitaba…
Vicky se ha dado cuenta de que Carol tiene últimamente una actitud muy sospechosa. Ha visto como mantenía una conversación con Amelia prácticamente a escondidas y como se ponía tensa cuando han cogido su usb. Todo indica que Carol es la traidora, pero las apariencias a veces, son engañosas. Marcos otra vez estará ciego de amor como ya le pasó con Amelia pero esta vez él solo será quien la descubra. Como Marcos necesita colarse en la habitación de Amelia para robarle la tarjeta que abre la puerta por donde se metió aquel hombre, descubre por casualidad como Carol entra en la habitación para dejarle algo a Amelia cosa que provocará que Marcos vuelva a creer que si que ahí un topo entre ellos. Todos excepto Carol han bajado a los pasadizos para ver que se esconde tras aquella puerta, pero Iván y Marcos acabaron encerrados en ese ascensor que solo tiene un pulsador para bajar. En cuanto bajan, lo primero que se encuentran es con los trajes para la radiación, pero pronto descubrirán que no están allí solos, ya que hay alguien más esta allí abajo y ven como sale de la zona que tienen habilitada para trabajar con la radiación. Deciden abrir una de las puertas que hay en el pasillo y encuentran unas grandes cámaras llenas de embriones. Carol, que les ha visto bajar a los pasadizos, corre a refugiarse en la habitación de Amelia.
Algo o alguien ha entrado en la enfermería por la noche y lo ha dejado todo patas arriba. Armarios abiertos, medicamentos volcados, muebles rotos y, de nuevo, la huella de un zarpazo animal. Además, el perro del guardabosques ha sido atacado y han muerto varias gallinas. Nadie sabe qué o quién está acechando el colegio. Nadie, excepto Paula, Evelyn y Lucas, que tienen clarísimo que se trata de un hombre lobo. Noiret responsabiliza a Amelia de este hecho, por no estar en lo que tiene que estar, pero Hugo, que siente un gran odio hacia Noiret, le dice que ella no es la única que tiene que estar antena, y les hace bajar los medicamentos a los pasadizos. 
Gracias a Lucas, Paula y Evelyn descubren que con una pieza de plata podrán espantar al monstruo; mediante plata. Tras conseguir guardar a Gustavo, el perro, en el internado para lograr que “el hombre lobo” no le ataque, Martín, termina dejando huir al perro. Temerosos, los pequeños salen del colegio en busca de Gustavo y allí, se encuentran con un extraño hombre a las puertas del internado. Con el miedo en el cuerpo, huyen a toda velocidad. Amelia, tras la muerte de su hermano, estaba decidida a ir a la policía para desenmascarar a la organización Géminis, pero un problema en el último momento hace que sufra un sangrado por el embarazo y tenga que ir al hospital sin poder poner la denuncia correspondiente. Tras haber tenido un enfrentamiento con Marcos y este le dijera por que había vuelto al internado si su hermano estaba muerto, Amelia recuerda el momento en el que decidió pedir ayuda a Ottox ya que su ginecóloga le había recomendado que abortara ya que era un embarazo muy difícil para ella, pero a cambio debía seguir trabajando bajo las manos de Géminis.
Rebeca, a través de Lucas ha descubierto que Martín tiene un barco, pero este lo niega ante todos los profesores. Por este hecho ha decidido hacer una pequeña investigación por su cuenta y descubre que en realidad no se llama Martín sino Emilio, y que está en busca y captura por el secuestro de su hijo. También ha descubierto que su barco estuvo atracado en un lugar muy cercano al que desaparecieron los Novoa – Pazos. Por este hecho decide colarse en su habitación para buscar más pruebas que puedan demostrar qué hacía por aquel lugar en aquellas fechas. Rebeca también ha descubierto que Martín guarda recortables de periódicos desde la desaparición del Matrimonio Novoa-Pazos, algo que hace que no exista inocencia alguna para el profesor de Física y Química. Fermín, que sabe que Rebeca está enamorada de él, le recomienda que investigue con su poder más cosas porque sino será él el que se encargue de sacarle toda la información.
A Rebeca le resulta muy difícil acercarse al profesor desde que le dijo que tenía el poder de ver las cosas malas que habían hecho las personas. Para que le resulte mas fácil decide ponerle un somnífero en la bebida y aprovechar mientras esta dormido, pero Rebeca no descubre nada bueno en esa visión, ya que verá como Martín apunta con una pistola a Novoa y luego se ve como alguien cae al agua. El mismismo Andrés.
Sandra, que por fin a descubierto que su marido está vivo, aprovecha que la han sacado de su celda para ir mirando por las ventanas de la puertas para ver si puede volver a ver a su marido y lo consigue ver: está en la celda contigua a la suya. La mujer consigue salir de su celda y entra en la de Andrés. Así le explica todo lo que ha pasado pero los guardias, vuelven a separarlos.
